突发事件应急指挥整体解决方案的总体目标是：实现对突发事件的动态监测与预警，面对突发事件时，可为领导与参与指挥的业务人员和专家，准备基本指挥场所，提供各种通讯方式、信息服务、决策依据和分析预测手段，领导和其他指挥者可进行指挥命令实施部署，同时监督执行情况。通过应急指挥系统的支持，指挥机构可及时、有效地调集各种急需的资源，实施应急控制和医疗救治工作，减轻突发事件对人民健康和生命安全所造成地威胁，用最有效地控制手段和最优的资源投入，将事件造成的负面影响与损失控制在最小范围之内。
        突发事件应急指挥总体结构由“一个中心、一个门户、三个系统支撑平台和三个核心应用平台”构成。一个中心指数据中心；一个门户指综合信息门户、三个系统支撑平台指安全管理平台、数据交换平台和系统监控和管理平台；三个核心平台指基础信息平台、专业分析平台和综合决策平台。
        基础信息平台是突发事件应急指挥中心进行数据与信息管理的基础平台，负责对数据中心数据模型的维护、基础信息的更新与管理。专业服务平台是突发事件应急指挥系统的核心，提供各种事件分析与地理信息分析工具，对各种突发事件的扩散与控制进行模拟，趋势预测与模型化分析。综合决策平台是突发事件应急指挥系统的最高层应用，完成对突发事件的监测、分析、研究、预测、决策、执行、反馈、信息发布的全过程，其中包含围绕突发事件应急处理的各种政务活动。
        突发事件应急指挥整体解决方案以应用服务器和消息中间件作为平台支撑，以J2EE框架、应用集成框架作为平台建构核心，通过工作流引擎、数据交换、全文检索机制、地理信息系统等实现平台的协调统一，保证了系统的灵活性、可扩展性和先进性。