电子与政务脱节
就目前来看，不少政府门户网站建设在信息的需求和供应、系统建设和应用、前台服务和后台业务、投入和效果等方面都存在着脱节的情况。
例如网站的信息量少，内容着重于政府宣传性信息，缺少对用户真正有用的信息;网站提供的服务少，功能不实用，大多数政府门户网站没有提供在线业务办理功能，信息搜索手段普遍较弱，交互性较差;网站一年到头都是老面孔，系统升级慢、信息更新不及时，有的网站甚至建好以后就不再更新，好像处在沉睡的状态;不少网站存在着用户少，访问量低，应用效果差的现象。
而造成这种现象产生的原因有方面。
网站本身定位不准确。目前有很多政府门户网站的内容仍是以一般介绍性信息为主，如机构、业务介绍等，提供动态性、交互性的信息不多，对公众真正有用的信息很有限。很多网站定位不准确，有的部门建网站主要是为了宣传形象，做表面文章。
电子和政务不衔接，表现在内部和外部信息交换渠道不畅，业务流程没有根据电子政务的需要进行相应调整，网站的服务功能不能体现出来。
功能设计不合理，功能设计没有以用户的需要为中心。
运行保障不落实。不少网站存在重建设，轻运维的现象。运行服务等保障措施不落实造成信息更新滞后。
此外，还有和体制改革不到位等原因，但归根结底主要还是主办方对网站建设重视不够，只是把它作为形象工程，没有把它作为服务的主要手段落到实处，也就是说电子和政务没有衔接起来。
寻找适当定位
那么如何建设政务网站，才能从根本上改变这种情况?
首先应该把握政府门户网站的特点，给出适当的定位。
一般而言，门户是面向用户提供信息服务的总入口，目的是提供信息引导，以方便用户能快速找到所需要的信息。因此，政府门户网站应该是政府对外服务的主要窗口之一，是和社会大众沟通的重要渠道。它的定位应该是以服务为主，其功能主要是索引的组织和查询功能的提供，以及相关信息的综合引用和链接。
其次，要发挥门户网站的作用，必须实现电子和政务的对接。要达到这个目标，需要采用综合和系统的方法及一系列有针对性的措施。
在指导思想方面要提高各政府部门对门户网站建设的目的和重要性的认识。要认识到电子政务建设的核心是政府利用信息化手段更好地为公众服务，而包括门户网站在内的电子政务系统是提高办事效率的有效手段。
在软环境建设方面，政府的信息化主管部门要对各部门的电子政务、信息资源和网站建设加强管理和引导。事实上，广东省信息产业厅、广东省信息协会从2003年开始对省直和地市政府网站进行评估，并已形成了一套较为科学的评价指标体系。经过这两年的评估，对广东省政府部门网站建设有较大的促进作用。
在业务层面要针对信息社会对政府信息服务的要求和电子政务业务处理的需要，对原有的业务处理流程进行分析和优化，把电子和政务真正衔接起来，充分发挥门户网站为民服务的作用。
在开发层面要做好网站功能定位，整合资源，深化应用，提供网上的一站式服务，同时要改善设计，使网站方便实用，提供人性化服务。
在运行管理层面则要健全配套的运作机制，建立长效的运行维护体系。
加强规划与管理
在寻找到合适定位的基础上，要让电子与政务有效结合，就要完善网站规划、网站与业务对接、运行管理等各方面环节。
在网站规划方面，主要包括信息资源规划、服务内容和业务规划、功能实现规划等等。信息资源规划主要是整合政府信息资源，落实信息提供渠道和方法，包括制定信息资源共享目录和元数据规范等，为跨部门的业务协同打下基础。
服务内容和业务规划重点是解决前台信息服务和后台业务流程的对接问题，也就是做好电子和政务对接的规划;前台主要承担信息交流、查询、业务受理、结果公布等业务处理，后台则承担了业务处理、部门协调等职能。通过规划把有关网上受理、文件配送、协同审批、在线支持、一站式服务等业务配套和完善起来。
功能实现规划方面，设计思想要以用户为中心，方便实用，不搞花架子。按服务对象的不同进行需求规划和功能设计，把服务项目和信息资源联系起来，提供灵活的信息查询手段，如搜索引擎和常见问题答案库，辅助查询工具等;以网站服务(webservice)的方式开发服务功能，提供信息服务;加强交互功能，提供在线支持等服务。
而在网站和业务对接方面，则要注意以下环节:
1、网站主动和业务对接以提高政务公开效率。政府门户网站是政府进行信息发布的主要渠道之一，网站的建设可以和政府的出版物的出版发行结合起来，如推出各种电子版，在网站设立相应栏目，定期更新。
2、业务和网站对接以改善服务。如建立用户服务台、呼叫中心、前台受理中心等服务机构，为用户提供在线服务。
3、加强双向互动的功能。利用网站资源，通过设立一些专题和论坛，提供一个参政议政、意见收集的渠道，并可接受用户的投诉。另外可进行民意调查，主动收集民情民意，为政府依法施政、科学决策提供基础。
4、内部业务系统信息化建设要同步进行，这样才能为网站提供所需的信息资源。
在运行管理方面，政府门户网站管理应走专业化的道路，可积极探索资源外包的模式，在条件成熟的情况下，把对外服务，业务受理等非关键性和决策性业务流程和环节规范化后外包，使服务社会化，有助于提高效率，降低成本，让政府集中精力管理核心业务。外包只是其中的一种模式，选择什么模式要根据自身的实际情况而定。不管采用什么运行模式，都要加强监督和管理，以保证信息安全和服务质量。
总之，政府门户网站建设是一个系统工程，涉及方方面面，需要有一个全面的总体规划，使各部分系统和流程做到互相协调和无缝连接。同时要处理好电子和政务的关系，把电子和政务衔接起来，才能充分发挥政府门户网站的作用。