近年来，北京检验检疫局的信息化建设可以说是突飞猛进：截至目前，他们已经构建了联通全局各工作点的全光纤网络平台；配备了满足各项工作需要的小型机和一系列服务器；建设了全局视频会议系统和全局电话组网系统；建成了北京检验检疫局网站和部分直属单位网站；开通了检验检疫便民服务自动应答咨询系统；建设了首都机场检验检疫局视频监控中心；并已建成了北京检验检疫局视频监控中心，可以将企业生产现场、北京各口岸检验检疫通道和查验平台、北京检验检疫局各分支机构报检大厅的视频信号接入，并适时控制。
北京局的信息化建设曾经一度停滞不前：随着国家质检总局CIQ2000综合业务管理系统的正式推行和业务量的增加，北京检验检疫局的服务器不堪重负，经常出现网路拥堵、影响业务办理的状况。该局党组早就意识到，信息化是当今社会加快政府职能转变、提高行政质量和效率、增强政府监管和服务能力、促进社会监督、降低行政成本的有效手段和途径。但是，由于北京局没有自己独立的办公大楼，无法对机房进行彻底改造，所以，这个空白点一直没有得到弥补。
2003年，随着新办公楼的建设完成并投入使用，局长魏传忠适时提出了“努力打造信息化、数字化局”的概念和思路，决心建设更高水平的基础网络，以适应当今社会的发展。3年多来，可以说北京局的信息化建设发生了翻天覆地的变化。在全面加强硬件建设的同时，他们在全局范围内选拔了一些业务熟练的人员组成了专家组，对各部门申报的信息化项目进行可行性分析，从软件开发的必要性、实用性、可操作性、急需性等多个方面进行论证，然后“自主创新”开发了一些实用性非常强的业务应用软件系统。
已经完成的主要有：“检验检疫流程监督管理系统”，该系统对CIQ2000检验检疫综合业务管理系统的业务数据进行实时分析和整理，从而实现对检验检疫工作流程的监督与控制，为工作流程时限的管理提供判断依据，同时也为绩效考核指标体系提供重要的考核要点。
“进境货物检验检疫监管库网络管理系统”，该系统突破现有的检验检疫管理模式，将口岸查验工作的时间从原来的报关后移至报关前，将查验地点从指定查货场地移至检验检疫监管库区内，实现了检验检疫监管库内货物查验放行工作的电子化、网络化管理，从而有效地缩短了检验检疫工作流程，同时加大了把关力度。
“进出口食品化妆品标签备案管理系统”，可作为首都进出口食品化妆品安全控制体系的技术支持系统，保证《2008年北京奥运食品安全行动纲要》的顺利实施；便于消费者了解进出口食品化妆品标签的信息；同时这也是各直属检验检疫局中第一个通过建立电子系统实施标签备案管理的方式。该系统提供的标签样张的互联网查询功能和PDA手机远程查询功能，便于检验检疫人员进行现场查验和市场检查，提高现场执法工作效率及准确度，有利于实现技术执法。
“进境货物检验检疫监管库网络管理系统”，突破现有的检验检疫管理模式，进一步提高了把关力度，通过调整查验工作方式，将“热情服务”落实到实处。该系统在原有检验检疫管理模式的基础上提出，彻底改变了原来手工操作方式所造成的工作效率较低，差错多，统计工作繁琐等的状况，加快了检验检疫的验放速度。该系统设置了审单、随机抽检、查验管理、处理暂扣、计费缴费管理、申报变更、归档处理、数据统计、查询等主要业务功能，能够快速准确地完成综合统计任务。
“检验检疫业务支持系统”，为在一线工作的检验检疫人员提供了检验检疫业务流程中各环节所需要的检验检疫法规、标准、作业指导、工作表格等信息，帮助检验检疫人员完成检验检疫记录，从而在实际业务工作中，达到规范检验检疫行为，统一标准，提高工作效率和工作质量的目的。
在加强硬件和软件建设的同时，北京局还专门成立了信息化工作领导小组，组建了信息中心，研究制定了《北京检验检疫局2006至2008年信息化建设规划》，计划用2至3年的时间，全面提高北京局信息化水平，把北京局建设成为信息化局、数字化局，为检验检疫各项工作的顺利开展创造良好的条件。
按照国家质检总局的要求，北京局以信息化建设成果为基础进一步加强了对推进电子监管工作的领导，坚持“局信息化领导小组策划、信息中心搭台、各部门唱戏、齐抓共建”工作思路，统一规划，分步实施。为了加大北京局信息化建设的力度，该局成立了信息化建设领导小组，负责制定信息化建设的大政方针，由局长任组长，分管副局长具体负责，主要职能部门负责人参加并要求各部门主要负责人亲自推动本部门的信息化建设，指定专人负责技术支持。在局内建立两级联席会议制度，切实落实信息化建设任务。同时，还制定了实行电子监管的一系列制度和规则，加强了对外宣传和对内培训。预计到今年年底，北京地区安装调试完成电子监管系统的企业将达到300家，90%以上的出口报检批通过电子监管系统签证放行。
据了解，北京局的信息化工作已经勾勒出了未来三年的发展蓝图：利用现代信息技术，将全局检验检疫业务、行政管理、检测技术、科研标准、后勤保障等工作移植到一个数字网络的空间环境下，从而达到提高全局的工作效率、人才培养质量、技术保障能力、管理水平的目的，并最终将该局构造成为一个数字化的检验检疫机构。目前，北京局正朝着这个目标大步前行。